Le CNS est composé de :
- La DNSI
- Les Directions Régionales du Plan et de la Statistique (DRPS)
- Les Cellules de Planification et de Statistique (CPS)
- Les Observatoires: Observatoire de l'Emploi et de la Formation Professionnelle (OEF) , l'Observatoire des Transports, l'Observatoire des Marchés Agricoles (OMA), l'Observatoire du Développement Humain Durable (ODHD), les Bureaux de Statistique et de Suivi Evaluation (BSSE) , les offices compagnies et opérations agricoles et les autres services statistiques de structures techniques.
Par ailleurs, il existe un Comité de Coordination Statistique chargé d'assister la DNSI dans la définition, la coordination et la programmation de l'ensemble des enquêtes, études et travaux statistiques des services publics. Il est composé des Directeurs Nationaux de la Planification, des Industries, des Transports, de la Santé Publique, des Affaires Sociales, des Affaires Economiques, de la BCEAO...Il organisé en quatre sous-comités:
- Sous-comité des Etudes démographiques et sociales;
- Sous-comité des Statistiques agricoles et de l'élevage;
- Sous-Comité des Statistiques économiques et financières
- Sous-Comité des traitements informatiques